A Argos Editora da Unochapecó possui atualmente quatro grandes linhas editoriais.
Coleção Grandes Temas é composta por livros de diversas áreas do conhecimento, resultantes de pesquisas acadêmicas. A maioria dos autores são professores universitários, que adaptam seus textos de teses de doutorado, dissertações de mestrado, monografias de especialização e orientações de trabalhos de conclusão de cursos de graduação para a forma de livro. As obras são compostas tanto por textos de um único autor quanto por textos de diversos autores, apresentados como obra organizada. Enquadram-se, ainda, nesta coleção, traduções de livros de autores estrangeiros que possuem reconhecimento nacional e internacional. Essa junção entre as pesquisas de caráter stricto sensu, lato sensu ou oriundas de orientações e os textos de autores estrangeiros resulta no fortalecimento da coleção. A linguagem dos livros recebe um cuidado especial, tornando-se mais acessível ao público leitor, caracterizado por pesquisadores e profissionais da área de abordagem de cada livro ou por outros interessados nos temas tratados.
Coleção Didáticos é formada por livros destinados ao ensino acadêmico. São obras teórico-práticas que auxiliam na formação de estudantes. Seu conteúdo geralmente está relacionado a uma disciplina específica de formação superior, trazendo, além dos resultados de pesquisa sobre o assunto abordado, exemplos de uso e dicas para a prática do conteúdo. Enquadram-se, também, nesta coleção, obras com conteúdo voltado para a pesquisa de termos, antologias, geralmente destinadas para uso em bibliotecas. Os leitores dessas obras são, portanto, os alunos do ensino superior e do ensino médio, que podem utilizar tais conteúdos para desenvolvimento intelectual.
Coleção Regionais retrata os fatos e o cenário da região Sul do Brasil, mais especificamente do oeste catarinense, região onde a Argos Editora da Unochapecó está inserida. Os autores são, geralmente, professores universitários que adotam a região como fonte e foco de suas pesquisas. As obras estão relacionadas, em sua grande maioria, com acontecimentos históricos, conflitos sociais, abordagens políticas que fizeram e/ou fazem parte da realidade da população da região. Essa coleção destina-se a um público variado, incluindo os próprios pesquisadores, as pessoas que fazem parte da história regional e aqueles que têm interesse em conhecer a região, entre outros leitores.
Coleção Debates é composta por livros originados de pesquisas de docentes, estudantes de graduação e pós-graduação que contribuem para a construção do conhecimento sobre uma temática. Teoriza sobre a pesquisa realizada para compreender o modo de fazer, o habitat, o modus vivendi etc. do sujeito ou objeto de estudo. A linguagem é adequada para diferentes níveis de formação, trazendo à tona uma temática sobre a qual são apresentados diferentes olhares a partir dos próprios autores e da produção científica já existente. Os livros desta coleção podem subsidiar debates desde o ensino médio até a pós-graduação.